Αλλαγές πάντως αναμένονται και στην κυβέρνηση σε επίπεδο γενικών γραμματέων υπουργείων. Πρόθεση του Μεγάρου Μαξίμου είναι στο τέλος Σεπτεμβρίου να έχουν αντικατασταθεί όσοι γενικοί γραμματείς δεν θεωρούνται αποτελεσματικοί τόσο από άποψη έργου, όσο και από άποψη απορροφητικότητας ευρωπαϊκών κονδυλίων. Ήδη μία σχετική λίστα έχει παραδοθεί από τον υφυπουργό συντονισμού κυβερνητικού έργου Άκη Σκέρτσο, στον Γρηγόρη Δημητριάδη. Ενδεικτικό του τι θα επακολουθήσει αποτελεί η τοποθέτηση του πολύπειρου Δημήτρη Παπαγιαννίδη στη θέση του Γενικού Γραμματέα Γενικού Γραμματέα Ενωσιακών Πόρων  και Υποδομών στο υπουργείο Αγροτικής Ανάπτυξης, με σκοπό την άμεση βελτίωση της απορροφητικότητας των κονδυλίων που θα προκύψουν από το ταμείο ανάκαμψης.